10月17日凌晨，陕西省疾控中心接到陕西10月16日0时至10月17日7时新增的2例外省核酸检测阳性游客病例的标本后，立即复核并第一时间启动病毒全基因组测序工作。18日凌晨1时完成测序，鉴定毒株型别为德尔塔。本轮疫情前，陕西本土病例中无德尔塔毒株型别，病例1、2与近期陕西省接收的境外输入病例的病毒基因组同源性较低，无关联性。
18日测序结果上报国家疾控中心后，经初步比对分析，认定该变异株与同期内蒙古二连浩特疫情、新疆霍尔果斯疫情的毒株无关联性，为一轮新的疫情。同时，病例1的病毒全基因组序列被确定为本次疫情的参考序列，为其他疫情相关省份提供溯源依据。后续18日确诊的“旅行团”中另外5份病例标本的测序业已完成并上报国家疾控中心，22日确诊的3例标本的测序工作正在进行。
对所有输入病例和本土疫情中首发或者早期的病例开展基因测序，是加强疫情监测的重要内容之一。其主要目的是及时发现和分析感染来源，通过动态地监测病毒变异的情况，为后续调整防控政策等提供科学的依据。
